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Pharma
In der Pharmaindustrie dient die Tiefenfiltration überwiegend einer sehr starken Trubreduzierung, d. h. einer Entfernung von Partikeln < 5 µm, von Mikroorganismen und Pyrogenen in Ausgangs-, Zwischen- und Endprodukten.
Bei Anwendungen in der Biotechnologie findet die Filtration z. B. nach dem Abtrennen der Biomasse und vor der Konzentration der Wert- und Inhaltsstoffe durch Verdampfung oder Gefriertrocknung statt.